More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3456 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 391 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.74 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  59.7 
 
 		 385 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.27 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  44.97 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.96 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  40.65 
 
 		 413 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  42.55 
 
 		 400 aa  248  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.33 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 560 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  39.34 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.89 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  39.45 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  38.38 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  40.21 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.42 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  37.2 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  36.87 
 
 		 428 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  39.47 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.01 
 
 		 469 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.86 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  38.59 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  38.08 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  36.51 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  36.42 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  41.44 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  36.05 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.3 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  41.14 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  35.79 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  39.61 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  35.29 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.47 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  35.19 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  38.2 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  37.07 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  36.65 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  41.37 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  32.92 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.06 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.23 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.79 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.06 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  33.86 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.75 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  33.24 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  33.51 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.88 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.26 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  35.39 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.7 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  34.42 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.42 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  37.63 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  39.56 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  33.67 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  34.05 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  33.78 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  36.42 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  34.93 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.33 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>