More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6592 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 378 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.78 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.07 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  43.82 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.02 
 
 		 360 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.97 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  40.05 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.75 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.4 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.8 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.34 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.93 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.02 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.87 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.37 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 		 379 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  37.32 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 		 369 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.58 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.53 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.63 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.65 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  32.36 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  32.76 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 436 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  31.89 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  30 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.46 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.24 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  29.49 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  33.23 
 
 		 396 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  31.49 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  34.83 
 
 		 371 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  30.98 
 
 		 418 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.41 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  31.37 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.73 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  32.59 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  30.14 
 
 		 476 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  29.86 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  28.69 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  31.01 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  30.26 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  31.3 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  29.75 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  30.91 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  30.25 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  31.44 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>