More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1622 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 415 aa  801    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  43.33 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  44.06 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 405 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  38.9 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  38.32 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  35.99 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 441 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  35.08 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  36.11 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  37.4 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 386 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.36 
 
 		 392 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  33.89 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.93 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.54 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  35.73 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  37.8 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  37.8 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  36.42 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.77 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.24 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  34.25 
 
 		 398 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  36.29 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.81 
 
 		 560 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.36 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  31.77 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 387 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  32.41 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  36.5 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  37.05 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.99 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.68 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.98 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  33.05 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.77 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.83 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.83 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  34.42 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 367 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  39.81 
 
 		 376 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  31.63 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.83 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.52 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  36.84 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.91 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.5 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  34.27 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  34.35 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.51 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0565  CmeA  30.51 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000015665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.72 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.26 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.26 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.26 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  32.87 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  34.16 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  33.89 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  36.28 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  36.39 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  32.78 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>