More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5495 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  79.63 
 
 		 386 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.96 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  68.14 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.37 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  49.59 
 
 		 378 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  48.43 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.18 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  48.18 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  51.45 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  49.55 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.97 
 
 		 446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.77 
 
 		 394 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  47.47 
 
 		 447 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  46.85 
 
 		 428 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  48.62 
 
 		 430 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  46.8 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.56 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.46 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  48.06 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.55 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.92 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  46.65 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.68 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.46 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  45.48 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  46.42 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.02 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  49 
 
 		 434 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  46.57 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.02 
 
 		 412 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  45.14 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  44.75 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  46.19 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  48.4 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  45.99 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  45.07 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  46.31 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  45.78 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  47.46 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 392 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.67 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  47.11 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.58 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.29 
 
 		 423 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  44.93 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.19 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.29 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  45.89 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  47.98 
 
 		 430 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.15 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.35 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  44.18 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  46.3 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  42.16 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  44.15 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61893  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.08 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  42.55 
 
 		 379 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2742  secretion protein HlyD  45.69 
 
 		 401 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  48.7 
 
 		 356 aa  260  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  46.41 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  45.25 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  47.04 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  40.22 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.91 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  40.57 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  45.24 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.03 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  45.32 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  41.39 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 384 aa  252  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.85 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  44.08 
 
 		 400 aa  252  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  44.2 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  40.22 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  40.22 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  41.89 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  40.22 
 
 		 388 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  42.08 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  43.75 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  41.8 
 
 		 409 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.62 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  41.4 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  41.8 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>