More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1460 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 367 aa  740    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  55.87 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  59.2 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  56.85 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  61.11 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  55.25 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  55.92 
 
 		 387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  53.57 
 
 		 380 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  52.77 
 
 		 378 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  52.08 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  48.18 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  47.2 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  46.55 
 
 		 385 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  44.79 
 
 		 406 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  48.64 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.95 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  47.45 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  47.72 
 
 		 434 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.51 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  44.74 
 
 		 415 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  47.15 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.15 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  46.81 
 
 		 433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  43.07 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.21 
 
 		 433 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  46.99 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  40.91 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.57 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  43.9 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.27 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  43.3 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  42.68 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  43.3 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  43.29 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.11 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  47.27 
 
 		 430 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  45.99 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  46.22 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  41.74 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  45.92 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  42.27 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  42.27 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.35 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  41.98 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  41.28 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  41.98 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  44.05 
 
 		 415 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.49 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.64 
 
 		 410 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.49 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.49 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  44.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.08 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  42.64 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  42.64 
 
 		 382 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.07 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.13 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  42.64 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.82 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  44.87 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.97 
 
 		 423 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  45.17 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  42.25 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  43.67 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  43.9 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.99 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.85 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  42.73 
 
 		 382 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  42.99 
 
 		 381 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  44.21 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.67 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.95 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  44.71 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.28 
 
 		 393 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.2 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  42.9 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  44.31 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  43.03 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  46.18 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.69 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  42.02 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  42.01 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  42.99 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  45.67 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  38.29 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  41.69 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  41.69 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  45.92 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  41.69 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>