More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2941 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 397 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.64 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.07 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  56.73 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  54.32 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.36 
 
 		 394 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  50.73 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.41 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.41 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  49.41 
 
 		 441 aa  315  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.58 
 
 		 385 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  48.41 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  50.88 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  47.78 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  50.43 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  51.95 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.45 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  45.3 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  51.04 
 
 		 402 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  51.16 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.32 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  48.08 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  46.7 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.29 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  45.88 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.51 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  49.85 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.49 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  47.17 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  49.11 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.67 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  47.19 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  41.34 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  44.38 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  42.31 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  42.31 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  46.69 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  41.79 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  46.69 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  41.06 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  44.21 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  47.66 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  44.83 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  45.32 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  41.06 
 
 		 385 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  46.07 
 
 		 410 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  47.7 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  43.63 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  44.61 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  45.32 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.04 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  47.08 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.94 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  46.9 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.8 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  43.55 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  42.62 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.55 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.63 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  46.08 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  49.57 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.57 
 
 		 398 aa  279  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.61 
 
 		 415 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  46.79 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  46.96 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  42.69 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  43.94 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.31 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  43.94 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  45.51 
 
 		 420 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  45.73 
 
 		 412 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  43.94 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  44.47 
 
 		 379 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.95 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  42.41 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  41.8 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.9 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  44.94 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  44.94 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  44.94 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  43.15 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  45.01 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  47.76 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  44.94 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  44.38 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  42.08 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>