More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3685 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 398 aa  796    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.39 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  73.39 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.58 
 
 		 446 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  70.99 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  73.78 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.87 
 
 		 385 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  52.56 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  53.01 
 
 		 378 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  51.1 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  53.48 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  50.6 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  52.72 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.28 
 
 		 390 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.05 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.9 
 
 		 384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.44 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3781  secretion protein HlyD  51.91 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.012367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.96 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.34 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2742  secretion protein HlyD  51.6 
 
 		 401 aa  318  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3329  secretion protein HlyD  49.57 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  46.63 
 
 		 386 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  47.62 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.45 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.45 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.55 
 
 		 410 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.92 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  49.32 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  43.35 
 
 		 395 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  43.35 
 
 		 395 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  43.87 
 
 		 388 aa  308  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  48.23 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.32 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.31 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  45.41 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  46.06 
 
 		 367 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  43.87 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  47.63 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  44.96 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 422 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.6 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  43.86 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  48.66 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  48.15 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  43.75 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.15 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.03 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.15 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.37 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  48.37 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 		 384 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  48.66 
 
 		 397 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  45.21 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  45.97 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  44.62 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  44.62 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.82 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  44.65 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  44.47 
 
 		 382 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  44.93 
 
 		 428 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  44.2 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  46.17 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  45.31 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  45.76 
 
 		 432 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  46.17 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  45.76 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  46.03 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  48.82 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  45.91 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  45.91 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  44.57 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  44.44 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  44.57 
 
 		 424 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  44.57 
 
 		 424 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  45.91 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  44.74 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  46.37 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  45.25 
 
 		 412 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  44.23 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  44.48 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  44.51 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.57 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  44.39 
 
 		 420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  44.23 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  45.76 
 
 		 416 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  46.41 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.23 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  44.23 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  44.23 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>