More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1776 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  100 
 
 		 379 aa  760    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  53.7 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  46.44 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1559  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  47.11 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0416  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  45.21 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0390  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  46.47 
 
 		 367 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1590  RND efflux system, membrane fusion protein CmeA  44.66 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0565  CmeA  43.24 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000015665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 413 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.7 
 
 		 405 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  33.42 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.07 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  30.32 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  33.14 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 427 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.05 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.79 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  34.41 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  34.32 
 
 		 415 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  34.22 
 
 		 430 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  30.16 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  32.25 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 		 405 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  31.89 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  30.43 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  32.36 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.83 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  32.35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  31.98 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  32.35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  31.62 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  32.35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  32.09 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  34.71 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  32.09 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  32.09 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.36 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.17 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 436 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  33.33 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  33.15 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  31.77 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  31 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  32.88 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.75 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  31.29 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  31.09 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  28.46 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  32.88 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.73 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  29.52 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  31.05 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  34.97 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  32.61 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  34.97 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.5 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  31.01 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  32.21 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  29.2 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  31.35 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>