More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3306 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 376 aa  743    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  60.54 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  57.4 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.23 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  54.33 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.89 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  51.35 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.28 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  40.78 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  43.51 
 
 		 381 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.52 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  42.65 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.06 
 
 		 408 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  41.94 
 
 		 426 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.74 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  38.61 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  40.62 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  40.34 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  41.81 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.01 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  38.81 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2649  RND family efflux transporter MFP subunit  37.72 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 392 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.89 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  35.84 
 
 		 429 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.14 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.46 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.54 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.79 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  37.99 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.59 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  33.97 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  34.86 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  33.75 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 400 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  36.31 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  36.17 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  35.38 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.55 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.91 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  32.61 
 
 		 417 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.8 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.68 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  33.23 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.26 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  34.82 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.4 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  33.75 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  33.96 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  34.06 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  35.97 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  35.8 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  33.6 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  34.01 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  32.98 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.8 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  32.15 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  37.04 
 
 		 379 aa  176  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.15 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  33.13 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  35.09 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  34.48 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>