More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4140 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  97.02 
 
 		 445 aa  834    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.37 
 
 		 441 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 436 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.86 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  51.87 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  53.37 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  50.93 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  52.99 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.21 
 
 		 408 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  45.36 
 
 		 386 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2649  RND family efflux transporter MFP subunit  45.37 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  40.39 
 
 		 373 aa  252  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  39.05 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  39.05 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.9 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 371 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.02 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.68 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  39.66 
 
 		 374 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  35.81 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  36.1 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  33.8 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.09 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 383 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  33.92 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.84 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.45 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.75 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 434 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 381 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.39 
 
 		 560 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.23 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  33.59 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  32.76 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  32.06 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  33.93 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.97 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.38 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.89 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.99 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  32.58 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.03 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 416 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  32.06 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  32.85 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  32.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  32.46 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  34.89 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.67 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  30.6 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  33.33 
 
 		 409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.54 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 415 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 410 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 391 aa  163  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.23 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  31.3 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  31.98 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.8 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  33.33 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 385 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  33.33 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.78 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.2 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.85 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  31.18 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>