More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32400 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  100 
 
 
414 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  98.79 
 
 
414 aa  828    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  74.07 
 
 
417 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  75.6 
 
 
412 aa  594  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  73.38 
 
 
413 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  71.04 
 
 
414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.91 
 
 
413 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  70.91 
 
 
413 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  70.91 
 
 
413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  71.25 
 
 
413 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  73.33 
 
 
412 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  49.75 
 
 
415 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  52.79 
 
 
412 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  53.05 
 
 
412 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  52.79 
 
 
412 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  52.52 
 
 
476 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  52.88 
 
 
418 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.62 
 
 
412 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  50.62 
 
 
412 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  50.62 
 
 
412 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  50.62 
 
 
412 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  49.88 
 
 
412 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  47.45 
 
 
428 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  48.58 
 
 
410 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  47.35 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  50.58 
 
 
411 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  48.88 
 
 
388 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  46.9 
 
 
392 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.54 
 
 
408 aa  322  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.96 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.96 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  51.01 
 
 
387 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 
405 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 
405 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 
405 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  47.14 
 
 
405 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 
405 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  46.65 
 
 
414 aa  315  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.85 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  46.88 
 
 
405 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  47.27 
 
 
408 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  49.71 
 
 
438 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  46.42 
 
 
391 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  47.58 
 
 
404 aa  309  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  47.18 
 
 
427 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  50.99 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.95 
 
 
419 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  48.71 
 
 
409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  48.71 
 
 
409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  48.71 
 
 
406 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  48.71 
 
 
406 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  48.71 
 
 
406 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.03 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  48.71 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  49.13 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  45.48 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  43.6 
 
 
371 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  49.3 
 
 
405 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  48.68 
 
 
418 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  46.32 
 
 
429 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  47.23 
 
 
391 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.5 
 
 
399 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  47.62 
 
 
396 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  42.05 
 
 
406 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  44.62 
 
 
409 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  47.31 
 
 
411 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  45.22 
 
 
414 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  45.14 
 
 
400 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  46.65 
 
 
413 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  44.74 
 
 
396 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1902  secretion protein HlyD  46.8 
 
 
409 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.555792  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  42.9 
 
 
382 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.64 
 
 
435 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.76 
 
 
396 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1624  RND efflux membrane fusion protein precursor  45.86 
 
 
385 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000143743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.24 
 
 
420 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 
396 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18760  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  45.01 
 
 
385 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0384088  normal  0.0956018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  39.55 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 
414 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  44.41 
 
 
386 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  45.71 
 
 
400 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4358  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 
421 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  45.71 
 
 
400 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  45.71 
 
 
400 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  45.76 
 
 
414 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  40.92 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  40.26 
 
 
371 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  41.96 
 
 
393 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  45.68 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  44.07 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  46.05 
 
 
408 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.89 
 
 
408 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  46.27 
 
 
402 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  40.72 
 
 
365 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  46.13 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  45.71 
 
 
408 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.09 
 
 
408 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  46.33 
 
 
407 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>