More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0320 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 407 aa  793    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  63.66 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.9 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.56 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  67.28 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.16 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  63.81 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  60.67 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  65.57 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  63.22 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.31 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  57.22 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.23 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.39 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4358  RND family efflux transporter MFP subunit  60.74 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  58.21 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  59.59 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1902  secretion protein HlyD  59.09 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.555792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  61.05 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1349  RND family efflux transporter MFP subunit  60.96 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  58.33 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  53.49 
 
 		 438 aa  342  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.44 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.44 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  50 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  50.58 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  48.45 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  47.06 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  46.7 
 
 		 405 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  47.21 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  47.21 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  46.7 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  47.21 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  48.06 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  48.06 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  48.06 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  46.97 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  48.06 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  48.06 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.83 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  48.06 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  49.86 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  48.17 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  48.92 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1298  secretion protein HlyD  63.71 
 
 		 253 aa  300  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  46.62 
 
 		 405 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  45.59 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  49.14 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  43.48 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  46.29 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  45.01 
 
 		 413 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  43.63 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  45.58 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  45.61 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.3 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  45.3 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  45.19 
 
 		 414 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  44.92 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  43.12 
 
 		 396 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  45.72 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  42.51 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  40.89 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  40.89 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  41.85 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  40.89 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  41.69 
 
 		 476 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  42.08 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  42.06 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  42.06 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  43.61 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  42.06 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  41.48 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.05 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  38.5 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  40.23 
 
 		 392 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  40.88 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  39 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  40.9 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  40.22 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  40.91 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  40.35 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.92 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  39.25 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  40.22 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.64 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  40.22 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  41.64 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  40.22 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.35 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  38.67 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.64 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  39.66 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 		 377 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  40.61 
 
 		 413 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.7 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>