More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1531 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  100 
 
 		 406 aa  830    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  44.05 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.05 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  44.53 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  43.73 
 
 		 382 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  44.35 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  44.8 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  43.26 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  43.47 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.02 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  43.47 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.5 
 
 		 405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.47 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  43.77 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  43.48 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  41.51 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  43.97 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  42.62 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  42.62 
 
 		 386 aa  282  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  42.56 
 
 		 385 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  44.5 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  42.32 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  45.48 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  43.78 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.56 
 
 		 415 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  42.48 
 
 		 409 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  42.22 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  42.22 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.99 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  42.22 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.14 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  40.71 
 
 		 426 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.19 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.65 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.65 
 
 		 442 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  43.82 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  41.21 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  44.21 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  40.36 
 
 		 385 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  40.36 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.31 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  42.35 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  40.22 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 382 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  40.1 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  43.32 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  40.85 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  38.99 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  41.43 
 
 		 384 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  42.07 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  41.91 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  42.18 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.74 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  42.81 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  41.24 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.91 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  41.91 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  41.91 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  41.91 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.89 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  40.37 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.89 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.81 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  41.64 
 
 		 385 aa  262  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  42.11 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.51 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  39.61 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  41.64 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  41.64 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  46.46 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2512  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.72 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.83 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  41.53 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.37 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  42.09 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  40.23 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  42.49 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  41.92 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>