More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2435 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  99.48 
 
 
384 aa  783    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  786    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  38.9 
 
 
389 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 
398 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.56 
 
 
398 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  42.26 
 
 
387 aa  276  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  40.87 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.12 
 
 
404 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 
430 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  42.14 
 
 
392 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.63 
 
 
414 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0869  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 
352 aa  236  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.23 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  38.32 
 
 
412 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  38.95 
 
 
393 aa  229  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 
436 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  39.94 
 
 
398 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 
430 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  35.31 
 
 
371 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 
396 aa  202  8e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.56 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  35.89 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35 
 
 
396 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.71 
 
 
424 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  33.05 
 
 
418 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  33.52 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 
392 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.74 
 
 
416 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  35.76 
 
 
391 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  32.6 
 
 
387 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  34.71 
 
 
385 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 
408 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 
408 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.89 
 
 
392 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 
405 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  33.72 
 
 
409 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 
405 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 
396 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  32.71 
 
 
427 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 
384 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  32.41 
 
 
396 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  34.26 
 
 
406 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 
409 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 
409 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  34.26 
 
 
406 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  34.26 
 
 
406 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 
371 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  31.85 
 
 
411 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  32.81 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  33.75 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 
429 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  33.86 
 
 
386 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  32.55 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 
422 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.57 
 
 
391 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.47 
 
 
381 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  34.42 
 
 
413 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 
381 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 
381 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  30.81 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  32.01 
 
 
412 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  31.67 
 
 
382 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  32.87 
 
 
434 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  32.04 
 
 
413 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3814  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 
414 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.14573  normal  0.243008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
418 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.66 
 
 
435 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2464  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36 
 
 
390 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 
396 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  34.64 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.44 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  33.75 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  33.44 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  33.44 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  32.61 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  35.2 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  33.44 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  33.53 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  33.44 
 
 
408 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 
399 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  31.96 
 
 
391 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 
402 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  34.12 
 
 
377 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  35 
 
 
391 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  31.91 
 
 
414 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 
419 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  33.84 
 
 
430 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 
399 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 
377 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  31.69 
 
 
368 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>