More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0869 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0869  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 352 aa  716    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  37.5 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  37.21 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  38.39 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 389 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.3 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.68 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.93 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  36.17 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.74 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 412 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  34.59 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.44 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  30.47 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.01 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 409 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 409 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  30.92 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  30.92 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  30.92 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  30.92 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.85 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  30.92 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  31.81 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  30.64 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  30.37 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  31.2 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  30 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 		 411 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  32.94 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.86 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 427 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  32.62 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  31.91 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.29 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 417 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  30.67 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  30.49 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  30.23 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  28.33 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  28.2 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  30.03 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 414 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 430 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  29.89 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  29.62 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  30.77 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  29.16 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  29.15 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>