More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1451 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 369 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  75.28 
 
 		 372 aa  534  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  75 
 
 		 372 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  47.24 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  45.57 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.79 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  47.4 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  43.41 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.41 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  44.79 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  44.35 
 
 		 387 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  45.08 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.73 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  45.4 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  43.51 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  44.13 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  41.98 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.75 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  39.43 
 
 		 357 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  43.83 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.38 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.88 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  40.99 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  36.65 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  39.83 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.94 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  38.76 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  36.63 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  37.46 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  36.12 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  34.42 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.62 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  32.48 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.16 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.91 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  35.67 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  35.78 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  32.56 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  36.01 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.23 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  36.66 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  34.19 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  35.05 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 355 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  29.58 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.44 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  35.05 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  32.56 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  32.85 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.64 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  31.13 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  29.82 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.64 
 
 		 417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.11 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 418 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.41 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  31.19 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.65 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  29.65 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  32.26 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.05 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  30.14 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 416 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  31.17 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>