More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1424 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  100 
 
 		 358 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  58.6 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  50.99 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  54.6 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  53.8 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.7 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  50 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.44 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  48.12 
 
 		 369 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.5 
 
 		 362 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  47.65 
 
 		 361 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.21 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  43.48 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.33 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  39.15 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  43.49 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  39.89 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.47 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  41.96 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  38.66 
 
 		 355 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  38.38 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  38.66 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  37.71 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.01 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  37.98 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  41.37 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.39 
 
 		 367 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.2 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  36.63 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  37.96 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  35.54 
 
 		 523 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  35.38 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  34.29 
 
 		 396 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 		 396 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 367 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.78 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.98 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  35.05 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  36.92 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  34.03 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.59 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  34.49 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  32.16 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  31.49 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.76 
 
 		 361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  32.74 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  31.46 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  31.17 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  37.09 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.31 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.18 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  33.82 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  34.37 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  34.48 
 
 		 374 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  31.98 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  34.88 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  34.71 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  32.29 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.57 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  32.36 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  34.21 
 
 		 363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 379 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 369 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>