79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2012 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2012  secretion protein HlyD  100 
 
 		 352 aa  700    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  23.89 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  20.94 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  22.82 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  22.29 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  20.7 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  21.64 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.13 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.13 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.94 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  21.84 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  23.44 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  21.19 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  22.3 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  22.98 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  20.43 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.39 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  19.94 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.46 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  23.23 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.44 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.51 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  20.23 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  20.23 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  20.23 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.94 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  22.29 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4463  RND family efflux transporter MFP subunit  19.88 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  20.82 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  21.38 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4082  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.6 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  19.75 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  21.61 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3932  RND family efflux transporter MFP subunit  20.73 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.45 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.77 
 
 		 421 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0305  RND family efflux transporter MFP subunit  23.76 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.89 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  20.53 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.61 
 
 		 507 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  22.92 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  23.9 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  21.59 
 
 		 504 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  23.03 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  23.15 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  21.53 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.33 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  24.53 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0162  cation efflux system protein  20.17 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.002148  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0540  RND family efflux transporter MFP subunit  21.58 
 
 		 459 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2342  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.59 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  21.21 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  23.2 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  22.41 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  22.15 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3587  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  24.32 
 
 		 577 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  25.88 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  25.88 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.67 
 
 		 510 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0517  RND family efflux transporter MFP subunit  22.01 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.05 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 		 417 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  20.42 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>