More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2710 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3012  secretion protein HlyD  96.31 
 
 		 407 aa  715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2710  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 407 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3713  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  29.74 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  28.38 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 372 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.43 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  28.9 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  29.46 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.9 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  28.23 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.934665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  28.62 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  28.73 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3345  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  23.25 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.93 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  28.19 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.61 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  28.78 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  27.9 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  30.73 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.6 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.47 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.5 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  28.23 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0007  secretion protein HlyD  21.45 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0298949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  29.25 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  29.25 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  29.25 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  28.5 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5654  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  29.25 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  24.58 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  29.25 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.71 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  29.31 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  25.71 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  22.27 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.02 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.4 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  27.87 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  28.77 
 
 		 489 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  28.77 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  26.58 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  24.15 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.98 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  33.56 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  21.98 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  31.61 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  21.98 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.8 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>