More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2400 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  100 
 
 		 440 aa  881    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  72.03 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  50.75 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  37.96 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  37.8 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.07 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  33.07 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  36.02 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  34.39 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  31.53 
 
 		 367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.72 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  29.41 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  30.93 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  29.39 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  32.01 
 
 		 1405 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  30.27 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  27.14 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  30.61 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.04 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.04 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.45 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  26.49 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 358 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 		 376 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 359 aa  97.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 358 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 426 aa  93.2  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.64 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 354 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 354 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  27.45 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 354 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  29.5 
 
 		 394 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 349 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  28.66 
 
 		 358 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 349 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  27.59 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  29.03 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  28.83 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  28.23 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.26 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  35.8 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0112  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  28.52 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.15 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.23 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  29.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  25.18 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  27.05 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>