More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0949 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 390 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  57.62 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  59.03 
 
 		 389 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.33 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.17 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  31.84 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  33.9 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.47 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.16 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  30.96 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.9 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  28.61 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  28.61 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.42 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.7 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.49 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  32.54 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  31.13 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  28.37 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.92 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.59 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.6 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  27.94 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  26.75 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2750  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 		 489 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.29 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  30.22 
 
 		 281 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  30.67 
 
 		 281 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  31.85 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  31.09 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  31.09 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  31.84 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 438 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  34.42 
 
 		 319 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  31.09 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  30.64 
 
 		 350 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>