More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2520 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 406 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  54.17 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  48.28 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.07 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  47.29 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.44 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  43.6 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  48.53 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  42.43 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  41.25 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  44.94 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  44.94 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  43.98 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  43.99 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  45.25 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  45.25 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  45.14 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  45.14 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  37.58 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  30.92 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  32.6 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.35 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.42 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  30.36 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  29.52 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.4 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  30.59 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  32.47 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 372 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0266  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  24.25 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.99 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.84 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  28.11 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  28.11 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  28.11 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  27.06 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  30.2 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  26.69 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  26.69 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.15 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  30.12 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  26.39 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  25.95 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 287 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  27.95 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 438 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  27.94 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3628  secretion protein HlyD  27.35 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  27.61 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.61 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  26.02 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.1 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  28.36 
 
 		 366 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  30.9 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>