More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2408 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  100 
 
 		 404 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  76.98 
 
 		 404 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  67.65 
 
 		 405 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  61.73 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.17 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.27 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  54.57 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  50.86 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  49.75 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  48.51 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.09 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  51.36 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  49.63 
 
 		 400 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  50.99 
 
 		 401 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  51.24 
 
 		 401 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  51.24 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  47.54 
 
 		 406 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  50.12 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  50.12 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 417 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 		 363 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  31.76 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 419 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.33 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  32.57 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.54 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  32.24 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  32.24 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  27.95 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  33.03 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  27.67 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.89 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  28.35 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.48 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.05 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.82 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.82 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.26 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  29.5 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.72 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  29 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  28.25 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0266  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 212 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  28.1 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  28.1 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.76 
 
 		 461 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>