More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2750 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2750  secretion protein HlyD  100 
 
 		 399 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  22.78 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 451 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  28.81 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  37.02 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.35 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 476 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.7 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  33.89 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  28.34 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 		 340 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 		 455 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  28.48 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  28.48 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  28.35 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.16 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.16 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 414 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.16 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.16 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.52 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.52 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.45 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.28 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  27.6 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  26.85 
 
 		 444 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 426 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  27.03 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  27.03 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  23.53 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  27.03 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  28.89 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  27.03 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  32.7 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.06 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  27.03 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  26.57 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  25.95 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  26.57 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  26.57 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  30.58 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>