More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3561 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
420 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  94.76 
 
 
443 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  51.23 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.5 
 
 
396 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.63 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  44.02 
 
 
421 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  43.23 
 
 
424 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  41.97 
 
 
421 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  42.89 
 
 
426 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.62 
 
 
420 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  41.5 
 
 
430 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3255  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.44 
 
 
410 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  31.88 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  30.68 
 
 
407 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 
435 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.14 
 
 
400 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.79 
 
 
390 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  41.27 
 
 
401 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  29.48 
 
 
424 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
402 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.44 
 
 
407 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 
411 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.04 
 
 
405 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  30.79 
 
 
366 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 
361 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 
405 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  34.19 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.54 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  29.97 
 
 
449 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
376 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 
360 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 
404 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.87 
 
 
349 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  28.96 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  33.19 
 
 
253 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.53 
 
 
360 aa  93.2  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.22 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.39 
 
 
331 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.39 
 
 
331 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  31.52 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.39 
 
 
331 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.02 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 
405 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  27.68 
 
 
360 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  30.98 
 
 
338 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  31.37 
 
 
338 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.02 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.85 
 
 
417 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
540 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  31.88 
 
 
437 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.6 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  30.5 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  28.48 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.09 
 
 
526 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.07 
 
 
350 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.35 
 
 
460 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.98 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  27.25 
 
 
372 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.98 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  23.04 
 
 
607 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 
568 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.2 
 
 
351 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.72 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  23.95 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
348 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 
385 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.94 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 
404 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>