More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4295 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
466 aa  905    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  72.25 
 
 
458 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.37 
 
 
458 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.93 
 
 
458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.97 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 
424 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 
414 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 
478 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 
429 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 
471 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 
418 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 
419 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  32.4 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 
415 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.05 
 
 
451 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  30.07 
 
 
419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  30.69 
 
 
410 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.17 
 
 
453 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 
417 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 
416 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
393 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 
409 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  29.25 
 
 
394 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 
419 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  29.51 
 
 
429 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 
432 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  29.75 
 
 
446 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
429 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 
402 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 
413 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 
419 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.36 
 
 
428 aa  106  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
407 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 
390 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.58 
 
 
400 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  30.43 
 
 
430 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
442 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 
424 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 
387 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.99 
 
 
429 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 
430 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 
419 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 
431 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 
430 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.6 
 
 
407 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  31.27 
 
 
434 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.31 
 
 
371 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.31 
 
 
371 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  99.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  25.32 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 
405 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  29.76 
 
 
388 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  25.75 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  25.61 
 
 
372 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  27.23 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
410 aa  96.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 
406 aa  96.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  30.36 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  27.14 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  27.14 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 
517 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  26.35 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  30.14 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25.37 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25.37 
 
 
372 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 
416 aa  95.1  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  25.37 
 
 
372 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  25.27 
 
 
449 aa  94  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.63 
 
 
383 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 
489 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 
407 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  25.12 
 
 
372 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 
437 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  27.85 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  26.34 
 
 
399 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  23.67 
 
 
390 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.52 
 
 
399 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.43 
 
 
509 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  28.14 
 
 
425 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  26.26 
 
 
417 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>