More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0782 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 428 aa  865    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  56 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  56.23 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  52.88 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  48.22 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  50.12 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  48.01 
 
 		 442 aa  339  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.08 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.5 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  49.09 
 
 		 471 aa  329  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.04 
 
 		 430 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  49.73 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  49.73 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  46.19 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.5 
 
 		 466 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  42.05 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  49.05 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  44.98 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.73 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.96 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  39.01 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 413 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.02 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.29 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  39.52 
 
 		 402 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  37.67 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  37.87 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 407 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  43.09 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.79 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  35.59 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.73 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  37.94 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.37 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  32.77 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.43 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 493 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  31.03 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  32.21 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.92 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  34.64 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  34.64 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  34.64 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  30.97 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  34.04 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  29 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  32.4 
 
 		 372 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  32.09 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  32.09 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  32.09 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  33.55 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  33.55 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.55 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  32.09 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  28.31 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  33.01 
 
 		 371 aa  136  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  31.6 
 
 		 404 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.01 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  33.23 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  32.11 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  29.62 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  31.7 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  33.85 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  33.85 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  32.13 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.65 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  32.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  33.54 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  32.13 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  34.32 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  29.97 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  29.38 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  32.65 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  30.97 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>