More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0976 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  99.46 
 
 
372 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  98.39 
 
 
372 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  99.73 
 
 
372 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  100 
 
 
372 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  98.92 
 
 
372 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  83.65 
 
 
371 aa  624  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.38 
 
 
371 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  83.38 
 
 
371 aa  621  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  83.65 
 
 
371 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  79.73 
 
 
371 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  65.75 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  65.75 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  65.47 
 
 
370 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  68.1 
 
 
348 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  45.81 
 
 
397 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  44.88 
 
 
428 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  48.56 
 
 
420 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  45 
 
 
399 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  44.88 
 
 
435 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  44.71 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  44.91 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  44.91 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  44.91 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  44.2 
 
 
383 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  44.65 
 
 
382 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 
399 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  39.73 
 
 
408 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  39.46 
 
 
408 aa  248  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  40.38 
 
 
401 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  40.38 
 
 
401 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  40.38 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  36.2 
 
 
456 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.87 
 
 
410 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  43.21 
 
 
414 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  42.2 
 
 
389 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  40.05 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  37.73 
 
 
393 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  38.13 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  35.75 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.46 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.89 
 
 
397 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  38.64 
 
 
405 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.08 
 
 
387 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.38 
 
 
398 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  37.71 
 
 
416 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
416 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  36.41 
 
 
404 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 
410 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 
409 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  36.54 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  36.46 
 
 
416 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  40.23 
 
 
430 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.82 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  36.93 
 
 
405 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 
464 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 
428 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  36.44 
 
 
390 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  35 
 
 
399 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 
406 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 
406 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 
384 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  39.2 
 
 
444 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.4 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  34.46 
 
 
396 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  34.35 
 
 
394 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  39.71 
 
 
401 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  36.47 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 
445 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 
387 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  39.48 
 
 
569 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 
392 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 
407 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  32.3 
 
 
394 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  31.64 
 
 
377 aa  186  5e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 
393 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  30.23 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  31.88 
 
 
402 aa  180  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  31.2 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  32.29 
 
 
390 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 
409 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 
394 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  30.53 
 
 
390 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  30.53 
 
 
390 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
390 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 
401 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 
390 aa  153  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 
402 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  32.21 
 
 
413 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 
428 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>