More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3605 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
429 aa  818    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  52.38 
 
 
429 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.99 
 
 
428 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  50.81 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  42.49 
 
 
432 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  48.75 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  54.5 
 
 
433 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  47.6 
 
 
442 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.61 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  45.39 
 
 
471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  51.24 
 
 
446 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  51.2 
 
 
418 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.85 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  50.53 
 
 
418 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  50.53 
 
 
425 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45 
 
 
466 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  44.77 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  38.64 
 
 
398 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  48.04 
 
 
437 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.09 
 
 
404 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.89 
 
 
430 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  42.54 
 
 
429 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  39.3 
 
 
489 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 
419 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.85 
 
 
424 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  41.53 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  36.41 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.73 
 
 
419 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 
390 aa  216  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  39.4 
 
 
403 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.66 
 
 
465 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 
407 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 
444 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.88 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  34.79 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  33.41 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  41.55 
 
 
455 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  43.55 
 
 
394 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 
416 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  32.82 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.09 
 
 
493 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.72 
 
 
408 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.09 
 
 
400 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.72 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  30.07 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.07 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.1 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
416 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
416 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 
416 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
415 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 
432 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  30.72 
 
 
397 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
409 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
416 aa  119  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  29.44 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  31.97 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  30.48 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 
392 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  28.29 
 
 
399 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  25.19 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  22.54 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 
399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 
401 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 
387 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  30.36 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  25.15 
 
 
390 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  21.59 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  30.3 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.75 
 
 
390 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  25.24 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 
414 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  22.89 
 
 
377 aa  110  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 
407 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  29.25 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 
458 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  29.25 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  29.31 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  23.68 
 
 
402 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.53 
 
 
458 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>