More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3531 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  100 
 
 		 400 aa  789    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.22 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  31.87 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  28.92 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  29.36 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  31.51 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  28.78 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.66 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 493 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  27.41 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  29.38 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  29.38 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  29.38 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  29.38 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  29.38 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  29.38 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  29.38 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.23 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 		 393 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  30.58 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.12 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  27.61 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  29.6 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.51 
 
 		 429 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  29.1 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  28 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  29.1 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  27.03 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  28.92 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.9 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  28.28 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  27.92 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 437 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  28.86 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  28.11 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 430 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  26.47 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  27.71 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 438 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  27.95 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  29.37 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.37 
 
 		 453 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  25.49 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>