More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1204 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 471 aa  946    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.88 
 
 		 478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  47.1 
 
 		 429 aa  362  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.67 
 
 		 414 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.61 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.27 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.02 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  39.36 
 
 		 465 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 418 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 410 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.15 
 
 		 415 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  35.36 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.24 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.84 
 
 		 419 aa  232  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  30.59 
 
 		 458 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  30.75 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.26 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  29.12 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  30.05 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  28.36 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 505 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.54 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  28.01 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.37 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  26.97 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 448 aa  113  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 442 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  25.45 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.34 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  25.17 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  25.17 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  32.74 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  26.37 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  27.18 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  32.74 
 
 		 390 aa  107  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  32.74 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.39 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  26.12 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.36 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.97 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  24.66 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.75 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  25.45 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  28.29 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  24.89 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 416 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  26.94 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.38 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 405 aa  100  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 410 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 398 aa  99.8  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>