More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0987 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  100 
 
 		 419 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.53 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  67.46 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.38 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  61.89 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.1 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.51 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  42.52 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.98 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.26 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.49 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4154  secretion protein HlyD  31.7 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  32.16 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4285  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.48 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.23 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4295  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 466 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  normal  0.845427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  25.86 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 450 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 489 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.24 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.61 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.35 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  25 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  25.62 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  25.69 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.65 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  25.62 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  25.79 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  28.9 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.94 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  27.74 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  25.92 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.49 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  26.23 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6610  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260284  normal  0.566522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.63 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.99 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  25.25 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>