More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3265 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 404 aa  799    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.06 
 
 		 405 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  62.59 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  59.9 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  58.17 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  56.3 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  51.48 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  48.03 
 
 		 450 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  48.02 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  47.07 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  47.52 
 
 		 401 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  47.03 
 
 		 401 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  47.77 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  48.02 
 
 		 401 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.25 
 
 		 432 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  45.57 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  45.79 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  45.79 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 407 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  31.64 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  32.16 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.82 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  30.61 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  28.89 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  31.37 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  28.64 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 476 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.17 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  35.83 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  30.31 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  30.65 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 417 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.84 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.22 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.66 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.85 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.35 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  28.8 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  28.3 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  28.74 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  29.33 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  29.33 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  26.88 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  29.33 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.18 
 
 		 370 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.35 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  31.59 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  30.46 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  32.05 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  27.46 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>