More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5856 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  100 
 
 		 425 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  72.89 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  73.09 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  70.82 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  70.32 
 
 		 400 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  70.32 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  70.57 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  68.33 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  68.58 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  68.58 
 
 		 401 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  51.11 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  50 
 
 		 404 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  49.75 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.77 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  48.93 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  50.5 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.91 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 406 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.07 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  35.68 
 
 		 407 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.2 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 363 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  35.18 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 353 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  30.33 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  31.3 
 
 		 437 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  29.21 
 
 		 370 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  29.21 
 
 		 370 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  29.21 
 
 		 370 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.34 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.56 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0266  acriflavin resistance protein  40.58 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3628  secretion protein HlyD  30.1 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.98 
 
 		 357 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  22.92 
 
 		 372 aa  99.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 414 aa  99.8  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.53 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  27.65 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  27.66 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.11 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  27.41 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  26.27 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.11 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 407 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 387 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  27.94 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 380 aa  97.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  30.57 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.2 
 
 		 371 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  27.81 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.47 
 
 		 371 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.11 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.11 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25 
 
 		 517 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.11 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  27.81 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.2 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.2 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.55 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  29.04 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.2 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.2 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>