More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4735 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 432 aa  851    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  52.41 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  49.47 
 
 		 500 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.01 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.81 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.44 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  49.21 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  43.97 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.75 
 
 		 504 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 357 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  34.62 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  37.47 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  37.37 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  29.78 
 
 		 356 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  30.94 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  37.67 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  29.59 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  29.85 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  29.6 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.5 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.89 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  35.99 
 
 		 509 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.19 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.71 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.16 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.41 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.43 
 
 		 496 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.47 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  32.89 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.11 
 
 		 335 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 		 329 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.91 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  27.02 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  32.11 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 345 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.85 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 404 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  30.46 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  27.74 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 407 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.85 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  33.07 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  31.58 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  32.45 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  32.38 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  32.97 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.49 
 
 		 333 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  30.45 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  30.45 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  30.45 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  28.77 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.14 
 
 		 607 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  31.04 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 469 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  29.76 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  31.77 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>