More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2861 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  100 
 
 		 489 aa  961    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  64.08 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.09 
 
 		 432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.87 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.66 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.25 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  43.58 
 
 		 517 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.53 
 
 		 504 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  44.09 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  42.11 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  42.11 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  48.8 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  50 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  37.39 
 
 		 353 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  36.61 
 
 		 353 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  36.15 
 
 		 356 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 496 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  36.49 
 
 		 353 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  36.49 
 
 		 353 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  44.23 
 
 		 392 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  36.7 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.19 
 
 		 509 aa  143  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 634 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.71 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.09 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.09 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  31.88 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.27 
 
 		 417 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.68 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.74 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  28.82 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.03 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  28.21 
 
 		 342 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  27.61 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.45 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 509 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  26.65 
 
 		 424 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  27.32 
 
 		 347 aa  96.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.64 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  25.36 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  27.16 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 		 368 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 417 aa  93.6  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.65 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  24.71 
 
 		 329 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.37 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 344 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.95 
 
 		 335 aa  90.5  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  31.77 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  24.21 
 
 		 331 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  28.69 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 399 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25 
 
 		 344 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  30.67 
 
 		 390 aa  86.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 469 aa  86.7  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.49 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  26.57 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  26.55 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.22 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  27.14 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  23.56 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  26.68 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>