More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3253 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.39 
 
 		 496 aa  971    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 496 aa  986    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.25 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  35.54 
 
 		 634 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  34.6 
 
 		 437 aa  253  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  32.9 
 
 		 439 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.58 
 
 		 463 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.56 
 
 		 401 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 422 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  33.01 
 
 		 500 aa  177  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.47 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  35.79 
 
 		 364 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  38.5 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.93 
 
 		 517 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  38.6 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  32.3 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  30.68 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  30.31 
 
 		 380 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0553  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  25.18 
 
 		 609 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.43 
 
 		 379 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  30.49 
 
 		 376 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 505 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 487 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 500 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  30.57 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  31.87 
 
 		 607 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.83 
 
 		 421 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 394 aa  87.4  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  24.57 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 374 aa  87  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 340 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 354 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.43 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  29.77 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  28.39 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.02 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  26.4 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  22.51 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  23.84 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  28.64 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.66 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  28.39 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  30.33 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.49 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  28.44 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  24.89 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.66 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  32.19 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  25.17 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  28.17 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  27.98 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.27 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.88 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  33.11 
 
 		 320 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  27.11 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.39 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  27.96 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  28 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>