More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1493 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 332 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  52.77 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  50.17 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  46.15 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  50.16 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  45.65 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  47.93 
 
 		 340 aa  248  8e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  42.9 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  44.33 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  46.1 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  47.33 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  47.33 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  47.33 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  48.17 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  46.67 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  49.31 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  48.17 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  44.83 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  43.89 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  44.63 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  44.95 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  39.5 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  41.75 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  39.18 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  43.77 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  43.37 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  43.37 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  44.24 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  46.58 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  45.94 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  43.12 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 354 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  42.16 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  34.37 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  34.82 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  37.07 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  34.37 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  42.62 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  39.73 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 377 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  33.97 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  33.74 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  32.19 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  32.75 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  34.24 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.45 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  32.03 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  31.16 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  30.82 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  28.85 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  32.53 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  32.89 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  33.69 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  32.53 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  31.82 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 541 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  29.41 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.48 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  29.41 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  29.41 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  28.48 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  29.41 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  31.21 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>