More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3892 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 352 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  39.67 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  42.3 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 399 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 500 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.35 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.96 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  32.78 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  35.98 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  28.45 
 
 		 500 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  28.72 
 
 		 399 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.89 
 
 		 432 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 		 430 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  33.95 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  35.21 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  34.04 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 421 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  32.63 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.15 
 
 		 430 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.27 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  29.51 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  35 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 395 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  34.77 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  32 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  27.61 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 471 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.78 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  32.17 
 
 		 424 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.93 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  34.28 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.28 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  31 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  29.6 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  33.48 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  33.21 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.11 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.11 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.9 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  28.47 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.29 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  30.04 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  30.54 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  30.42 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  29.67 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  32.9 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  32.9 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  26.87 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.4 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  25.06 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  31.09 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>