More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2249 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  100 
 
 
399 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.19 
 
 
428 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  48.36 
 
 
399 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  54 
 
 
406 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.34 
 
 
439 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.95 
 
 
607 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  50.44 
 
 
399 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  43.64 
 
 
408 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  42.72 
 
 
434 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  47.51 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  47.24 
 
 
438 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  44.59 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  43.68 
 
 
444 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  45.27 
 
 
361 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  42.71 
 
 
414 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  41.65 
 
 
479 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  41.83 
 
 
474 aa  279  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  40.26 
 
 
398 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  38.64 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  28.96 
 
 
401 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  29.31 
 
 
294 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  26.61 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  26.67 
 
 
305 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  26.36 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.63 
 
 
345 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  26.29 
 
 
304 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 
504 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  27.27 
 
 
298 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.59 
 
 
517 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
496 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  40.34 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.72 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.61 
 
 
500 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.41 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.04 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  28.25 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  35.29 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  35.29 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  35.29 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 
333 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  29.09 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  35.77 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.12 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  29.77 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  24.7 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  27.73 
 
 
353 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 
479 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.39 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  30.21 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  30.94 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.48 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  30.21 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  29.06 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.62 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 
621 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  28.66 
 
 
427 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.1 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.31 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  24.71 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  25.85 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.71 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  26.57 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.06 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.15 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  25.46 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  26.12 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  28.63 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 
516 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  22.92 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.11 
 
 
354 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 
516 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 
462 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  23.28 
 
 
359 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  25.77 
 
 
349 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
453 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.17 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 
490 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  25.69 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  27.78 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 
609 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>