188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1232 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  100 
 
 		 444 aa  881    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  50 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  51.52 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  51.36 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.23 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.64 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.47 
 
 		 607 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  42.92 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  42.37 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  42.69 
 
 		 438 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  43.68 
 
 		 399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  44.87 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  41.71 
 
 		 408 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  41.4 
 
 		 414 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  39.77 
 
 		 479 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  38.04 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  34.63 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  32.06 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  29.01 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  40.16 
 
 		 294 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  27.25 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  30.48 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  30.48 
 
 		 305 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  38.66 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  36.97 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  37.82 
 
 		 303 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  37.82 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  37.82 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  37.82 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  25.06 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.79 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.35 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  34.45 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.83 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.08 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  23.29 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  26.23 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.16 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  24.34 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  24.67 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.07 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.58 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.16 
 
 		 368 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  22.36 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  26.56 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  33.58 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  23.45 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  25.62 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.09 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.16 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.16 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  22.68 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.38 
 
 		 509 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 621 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  24.7 
 
 		 467 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  24.6 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 549 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 549 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  23.1 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  23.78 
 
 		 340 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  25.48 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  25.32 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  25.57 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  25.37 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  28.26 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  25.32 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  23.68 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>