More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2744 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 475 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.15 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.94 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.42 
 
 		 422 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.53 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  34.23 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  34.03 
 
 		 437 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  30.63 
 
 		 376 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.57 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  38.3 
 
 		 634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  33.62 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  30.8 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  31.98 
 
 		 380 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  33.49 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.05 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 403 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 417 aa  90.5  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  29.62 
 
 		 354 aa  86.7  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  22.93 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  28.9 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.8 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  27.25 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  24.34 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  23.1 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  22.41 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.86 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.88 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.88 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  22.54 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  22.63 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  22.8 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  25.48 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  22.85 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  21.62 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  22.88 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  23.23 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  30.53 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  22.3 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  22.07 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.57 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  26.02 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  24.74 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  24.47 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  23.29 
 
 		 384 aa  67  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>