More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1441 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
634 aa  1258    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 
496 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 
496 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 
467 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  37.13 
 
 
439 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 
631 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.55 
 
 
401 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 
463 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 
463 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  40.2 
 
 
437 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 
504 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.2 
 
 
475 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  40.11 
 
 
376 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  37.23 
 
 
364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 
641 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.05 
 
 
500 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  29.33 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 
509 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 
487 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 
490 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  31.31 
 
 
376 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  33.83 
 
 
391 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
376 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  33.83 
 
 
391 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  29.96 
 
 
376 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 
375 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 
609 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 
374 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 
366 aa  100  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  24.46 
 
 
517 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  30.48 
 
 
502 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  25.14 
 
 
510 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  25.04 
 
 
621 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  31.75 
 
 
351 aa  97.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.56 
 
 
372 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
358 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
358 aa  94.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  31.35 
 
 
351 aa  94  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  31.7 
 
 
382 aa  93.6  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 
375 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 
372 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  28.24 
 
 
350 aa  92  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  31.25 
 
 
328 aa  91.3  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  29.29 
 
 
369 aa  90.9  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 
363 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 
369 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 
363 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 
370 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 
373 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 
370 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 
370 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 
502 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  29.78 
 
 
374 aa  87.8  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 
374 aa  87.8  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  29.28 
 
 
354 aa  87.4  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
380 aa  87  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  28.88 
 
 
381 aa  87.4  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.78 
 
 
380 aa  87  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 
354 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.45 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  27.6 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  30.96 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  29.77 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 
354 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  29.48 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 
392 aa  82  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 
354 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 
379 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.05 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 
516 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  28.77 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.35 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28.63 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  26.85 
 
 
360 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.14 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  25.19 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  27.31 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  27.53 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>