More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0308 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  100 
 
 
421 aa  847    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 
376 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 
509 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
354 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 
354 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.65 
 
 
379 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.3 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  31.98 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  34.27 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  30.08 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  34.27 
 
 
354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  30.8 
 
 
354 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  26.89 
 
 
370 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  30.52 
 
 
354 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.12 
 
 
352 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  29.66 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 
442 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.13 
 
 
426 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  27.34 
 
 
405 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.78 
 
 
373 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.45 
 
 
354 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.87 
 
 
426 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 
404 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
405 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 
364 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
435 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 
405 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 
392 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
405 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.71 
 
 
400 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 
379 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  29.41 
 
 
380 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 
387 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 
414 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 
426 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 
377 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 
353 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.05 
 
 
475 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
399 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.5 
 
 
417 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 
365 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  25.68 
 
 
405 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 
363 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 
373 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.01 
 
 
376 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  33.33 
 
 
322 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 
383 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 
361 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 
368 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.8 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.86 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  35.84 
 
 
348 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  27.22 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  22.75 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.94 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 
363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 
580 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 
363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 
386 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
505 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.87 
 
 
537 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
510 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  30.09 
 
 
505 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  28.81 
 
 
449 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
538 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
537 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  27.38 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>