294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3365 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 420 aa  844    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  78.57 
 
 		 420 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  80 
 
 		 420 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  77.38 
 
 		 420 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  68.11 
 
 		 420 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  68.11 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  68.59 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  66.19 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  66.67 
 
 		 435 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  67.39 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.95 
 
 		 420 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  65.95 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  65.71 
 
 		 435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  68.59 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  67.14 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  58.27 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  42.56 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  42.96 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0572  RND family efflux transporter MFP subunit  39.52 
 
 		 423 aa  283  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.58 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  38.82 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.59 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.39 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.33 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.9 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  23.22 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  20.77 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.64 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.2 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  22.09 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  21.81 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.67 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  25.98 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  31.52 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  21.29 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  21.86 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  20.78 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 388 aa  67  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  28.68 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  22.53 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.25 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  22.34 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.22 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2477  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2575  RND family efflux transporter MFP subunit  23.5 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  22.32 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.36 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.25 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3005  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000258393  hitchhiker  0.0000478824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.88 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.05 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  28.57 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  22.16 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  22.79 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  22.6 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.75 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.7 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.6 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.51 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  24.12 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.87 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.46 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.03 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  25 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  20.92 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.85 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  22.7 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  23.08 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.14 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 373 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 351 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  24.69 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.6 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  18.75 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>