More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1759 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 457 aa  913    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.25 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.84 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.06 
 
 		 607 aa  93.6  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  24.07 
 
 		 394 aa  90.1  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  23.57 
 
 		 417 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03081  ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.955285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  23.76 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.78 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 364 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  23.79 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.46 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  23.96 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  25.14 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.95 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  22.12 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.95 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  30.8 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  27.43 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  24.68 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  23.84 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  24.61 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  23.73 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  24.45 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  30.53 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.03 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.8 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  21.11 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  24.6 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  26.97 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.6 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  20.11 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  23.13 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  25.08 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.57 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.86 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  26.91 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  26.1 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  22.91 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  22.69 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  23.13 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  27.11 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  23.49 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  22.22 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.98 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  24.74 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  23.3 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.82 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  31.18 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  25.47 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.16 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.24 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  22.33 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>