More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0283 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 416 aa  835    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.78 
 
 		 419 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  22.91 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  24.29 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  24.94 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.86 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  24.29 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  23.67 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.06 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  23.76 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  23.54 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  22.14 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  23.34 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.36 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  24.59 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  25.49 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  21.67 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  22.28 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  24.31 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  19.9 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  23.5 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  22.03 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  29.15 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  20.2 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  18.59 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  21.52 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  21.15 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.32 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  22.36 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  22.56 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  20.18 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.47 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  27.89 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  22.46 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  22.06 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  22.06 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.46 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  22.06 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.57 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  26.53 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  23.48 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  24.65 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  22.95 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.84 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.3 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.22 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  22.17 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  25.49 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>