More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4678 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 442 aa  889    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.42 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.58 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.24 
 
 		 431 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  25.46 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  23.71 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.61 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  24.11 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.6 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  26.25 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  30.85 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  22.76 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  32 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  22.89 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.13 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  21.77 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  23.31 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  23.6 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  24.19 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.25 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  22.99 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  24.13 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  23.52 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  22.12 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  25.98 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  22.97 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  28.66 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.42 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  22.34 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  23.53 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.96 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.95 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  29.15 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.74 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  23.31 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  23.32 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.45 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.7 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.99 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.7 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>