More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1147 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
395 aa  740    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 
390 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.95 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.75 
 
 
392 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
388 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  32.61 
 
 
409 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 
435 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.25 
 
 
438 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.87 
 
 
400 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  28.5 
 
 
431 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 
419 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 
402 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 
407 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 
387 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  31.38 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  35.9 
 
 
399 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  38.78 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  28.39 
 
 
392 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  28.39 
 
 
349 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 
442 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 
407 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  32.51 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  29.75 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  33.21 
 
 
398 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  27.51 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.37 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  31.54 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  36.73 
 
 
393 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.73 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  32 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0558  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.22 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.11 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.92 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 
607 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  23.74 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  27.35 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.86 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.56 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.54 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.63 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  31.47 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  30.96 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.63 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.05 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.35 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.77 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.43 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.7 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>