More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0567 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 424 aa  838    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.35 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.35 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  49.08 
 
 		 410 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  47.21 
 
 		 407 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.77 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  51.95 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  48.06 
 
 		 409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  46.24 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  44.33 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  44.83 
 
 		 410 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  45.58 
 
 		 392 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  44.92 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 400 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  41.86 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  42.06 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  40.36 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  40.36 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  37.5 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 472 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.39 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  36.48 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.1 
 
 		 400 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  38.85 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  39.88 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  40.52 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  41.61 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  39.09 
 
 		 455 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.38 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  35.24 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  32.36 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  37.01 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 1462 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  31.76 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  36.26 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  34.63 
 
 		 451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  31.94 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.54 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.01 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.62 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.91 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  32.32 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.25 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  30.75 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 376 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.92 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.92 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 415 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  28.92 
 
 		 415 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  28.92 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.8 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.62 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.62 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  28.16 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  28.48 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.5 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  28.92 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.18 
 
 		 1460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  28.32 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  28.75 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  28.61 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  26.04 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  28.61 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.99 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  27.13 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  28.31 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  25.54 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  28.31 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  27.87 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  25.61 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  28.07 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>